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 Chef de groupe :
Dr. Martin Young
(613) 990-0855
Martin.Young@cnrc.gc.ca
Contact d'affaires :
Scott Ferguson,
(613) 990-5948
Scott.Ferguson@cnrc.gc.ca
Centre d'intérêt du groupe :
Nous connaissons aujourd'hui les séquences
génomiques d'un nombre croissant de pathogènes bactériens,
et les progrès rapides réalisés dans ce domaine ont
révolutionné l'étude de la pathogenèse. L'analyse
de ces génomes par des méthodes telles que la bioinformatique,
les biopuces à ADN et la protéomique permet en effet de
découvrir des composantes vitales qui interviennent dans le processus
infectieux. Les composantes qui se trouvent à la surface des cellules
bactériennes - comme les glycanes, les protéines membranaires et
les protéines de surface - constituent des candidats de choix pour la
mise au point de vaccins, tandis que les enzymes responsables de leur
biosynthèse ou de la modification post-traductionnelle offrent des
cibles potentielles pour le développement de nouveaux agents anti
infectieux. Le laboratoire de protéomique mène des recherches sur
les maladies infectieuses et neurodégénératives ainsi que
sur le cancer chez les humains. Nous avons acquis une vaste expertise dans la
mise au point et l'application de méthodes d'analyse protéomique
sur gel et par spectrométrie de masse. Nous avons également mis
en place un solide programme de recherche axé sur la
caractérisation des modifications post-traductionnelles des
protéines, et plus particulièrement sur la glycosylation des
protéines. Le laboratoire a été désigné
centre névralgique de recherche en protéomique, dans le cadre de
l'Initiative en génomique et en santé du CNRC.
L'équipe :
Génomique: Dr. Martin
Young, David Watson, Sonia Leclerc, Dr. Smita Bhatia, Dr. John Nash, Brian
Agnew, Anne Bouevitch, Simon Foote, Oksana Mykytczuk, Dr. Wendy Findlay,
Christian Luebbert.
Protéomique: Dr. John Kelly, Dr. Jennifer
Hill, Tammy-Lynn Tremblay, Wen Ding, Luc Tessier, Marie-Soleil Giguère,
Mireille Petit, Dr Susan Twine.
Activités de recherche en cours :
À partir des séquences génomiques de
certaines bactéries pathogènes, principalement de Campylobacter
jejuni, Actinobacillus pleuropneumonia et Aeromonas salmonicida, nous
étudions la génomique fonctionnelle des
glycosyltransférases, des enzymes intervenant dans la
glycosynthèse et des protéines de surface. Nous avons
créé des biopuces à ADN pour étudier les processus
infectieux de ces trois organismes et procéder à leur typage
génomique.
Notre programme sur la
protéomique bactérienne porte sur deux pathogènes humains,
soit Francisella tularensis et Campylobacter jejuni. Nous utilisons
également la protéomique pour tenter de mieux comprendre la
pathologie de l'ischémie (accident vasculaire cérébral) et
d'autres maladies neurodégénératives. Notre groupe est
réputé à l'échelle internationale pour ses travaux
d'analyse des glycoprotéines bactériennes et, à l'appui de
la nouvelle initiative stratégique de l'ISB en neuroglycobiologie, nous
venons de lancer un nouveau programme sur la glycoprotéomique des
eucaryotes.
Partenariats possibles :
Nous
souhaitons travailler avec des collaborateurs des secteurs scientifique et
industriel ayant de l'expertise et de l'intérêt dans les domaines
suivants :
- Utilisation des biopuces à
ADN pour étudier la génomique comparative de la virulence de
certains pathogènes
- Création de nouveaux outils
de diagnostic à partir des résultats obtenus avec les biopuces
à ADN
- Examen du rôle des
molécules de surface dans la pathogenèse
bactérienne
- Compréhension de la biosynthèse des sucres
complexes et exploitation des enzymes pour la synthèse in vitro des
glucides.
Expertise et technologies disponibles :
- Investigation des changements d'expression des
gènes bactériens et de l'hôte à l'aide de
micromatrices à ADN
- Utilisation de la bioinformatique à l'appui de la
génomique et de la protéomique, pour le développement de
bases de données internes et d'autres outils pour l'utilisation des
biopuces à ADN et la collecte de données sur les séquences
génomiques
- Techniques d'analyse
protéomique sur gel et par spectrométrie de masse (c.-à-d.
électrophorèse sur gel bidimensionnel, marquage ICAT avec
nanochromatographie liquide couplée à la spectrométrie de
masse en tandem (ICAT-nano-CL/SM/SM), etc.
- Expertise dans la modification
post-traductionnelle des protéines
- Offre de certains services
d'analyse protéomique, selon un barème de
rémunération
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