Le CRSH est dirigé par un conseil d'administration nommé par le gouvernement fédéral pour représenter les intérêts du milieu universitaire et des secteurs public et privé.
Comités du conseil d’administration
Les comités du conseil d'administration guident le CRSH et s'assurent que ses programmes de subventions et de bourses répondent aux besoins des Canadiens.
Audit indépendant
Afin de veiller à la gestion responsable des fonds publics et de bien s’acquitter de ses obligations en matière de reddition de comptes, le CRSH s’est doté d’un comité d’audit indépendant, dont les membres sont nommés par le gouvernement fédéral.